Molecular Viz Pro apporte la visualisation moléculaire professionnelle directement

dans Blender. Importez des structures moléculaires depuis des fichiers ou des bases de

données en ligne, choisissez parmi plusieurs styles de visualisation et schémas de

couleurs, animez vos molécules et exportez des rendus prêts à publier

dans des revues scientifiques.

Prise en charge des formats de fichiers

Importez des données moléculaires depuis 5 formats standard :

- PDB : format Protein Data Bank avec métadonnées complètes, structure

secondaire et prise en charge de plusieurs modèles

- mmCIF : standard CIF macromoléculaire moderne pour les structures

protéiques complexes

- MOL/MOL2 : MDL Molfile avec connectivité des liaisons explicite (V2000 et

V3000)

- SDF : Structure Data Files avec prise en charge de plusieurs molécules et

extraction des propriétés

- XYZ : format de coordonnées simple pour une visualisation rapide

Accès aux bases de données en ligne

Récupérez des structures directement depuis trois grandes bases de données scientifiques

sans quitter Blender :

- RCSB PDB : plus de 200 000 structures de protéines par identifiant PDB

- PubChem : des millions de petites molécules par nom, CID ou SMILES

- ChEMBL : base de données de médicaments et de composés bioactifs

Des préréglages rapides pour les molécules courantes (aspirine, caféine, ibuprofène,

pénicilline) vous permettent de commencer à visualiser instantanément.

7 styles de visualisation

- Boules et bâtonnets : atomes sous forme de sphères reliées par des liaisons cylindriques, le

style polyvalent le plus flexible

- Remplissage d'espace (CPK) : sphères au rayon de Van der Waals complet montrant le

véritable volume moléculaire

- Fil de fer : uniquement de fines lignes de liaison, rendu rapide des grandes molécules

- Bâtonnets : liaisons épaisses sans sphères d'atomes, mettant en valeur la connectivité

- Cartoon : structure secondaire des protéines avec hélices en spirales,

feuillets en flèches et boucles en tubes

- Ruban : tracé lisse du squelette à travers les carbones alpha pour une vue d'ensemble

de la protéine

- Surface : surface moléculaire utilisant des metaballs pour une représentation de Van der Waals ou

accessible au solvant

8 schémas de couleurs

- CPK : coloration standard des éléments (carbone gris, oxygène rouge, azote

bleu)

- Chaîne : couleurs distinctes pour chaque chaîne protéique dans les complexes multi-chaînes

- Résidu : coloration par type d'acide aminé (hydrophobe, polaire, chargé)

- Structure secondaire : hélices rouges, feuillets jaunes, boucles grises

- Facteur B : dégradé du facteur de température pour visualiser la flexibilité

- Hydrophobicité : cartographie de l'hydrophobicité des résidus pour l'analyse de surface

- Arc-en-ciel : dégradé de l'extrémité N-terminale à l'extrémité C-terminale

- Personnalisé : coloration par atome définie par l'utilisateur

Détection de la structure secondaire

Un algorithme intégré de type DSSP identifie automatiquement les hélices alpha,

les feuillets bêta et les régions de boucle à partir des coordonnées atomiques, sans aucun

logiciel externe. Utilisé pour les styles Cartoon et Ruban ainsi que pour la coloration par

structure secondaire.

Animation

Donnez vie aux molécules grâce aux outils d'animation intégrés :

- Rotation : rotation autour d'un seul axe avec vitesse et lissage configurables

- Culbute : rotation simultanée sur plusieurs axes pour une présentation dynamique

- Vibration : effets de vibration atomique simulant l'agitation thermique

- Plateau tournant : caméra qui orbite automatiquement autour de la molécule

Export prêt à publier

Exportez des rendus de haute qualité optimisés pour les revues scientifiques :

- Préréglages de revues pour Nature, Science et Cell avec le style et la

résolution appropriés

- Préréglages de résolution du HD à la 4K, formats carrés et

tailles propres à chaque revue à 300 DPI

- Formats d'affiche A0 et A1 en résolution d'impression

- Formats de sortie : PNG, JPEG, TIFF, EXR avec profondeur de couleur de 8 ou 16 bits

- Option de fond transparent

- Prise en charge des moteurs de rendu Cycles et EEVEE

Préréglages de matériaux

6 styles de matériaux pour différents besoins de présentation : brillant, mat,

métallique, verre, style de la revue Nature et style de la revue Science. Chacun

contrôle la rugosité, l'aspect métallique, la spécularité et la transmission

pour un rendu physiquement précis.

Performances

Un système LOD automatique simplifie la géométrie des molécules de plus de

10 000 atomes. La mise en cache des matériaux évite les doublons. Les réglages configurables de qualité des atomes

et des liaisons concilient fidélité visuelle et fluidité

de la vue 3D.

Tableau périodique complet

97 éléments, de l'hydrogène à l'uranium, avec masse atomique précise,

rayon covalent, rayon de Van der Waals et couleurs CPK standard. 20

acides aminés standard avec valeurs d'hydrophobicité pour l'analyse

au niveau des résidus.

Configuration requise

- Blender 4.0 ou version ultérieure

- Aucune dépendance externe : utilise uniquement les modules intégrés de Blender

- Connexion internet nécessaire uniquement pour la récupération depuis les bases en ligne

- Fonctionne sous Windows, macOS et Linux