Molecular Viz Pro пропонує професійну візуалізацію молекул безпосередньо

в Blender. Імпортуйте молекулярні структури з файлів або онлайн-баз

даних, обирайте з-поміж багатьох стилів візуалізації та кольорових

схем, анімуйте молекули й експортуйте рендери, готові до публікації

в наукових журналах.

Підтримка форматів файлів

Імпортуйте молекулярні дані з 5 стандартних форматів:

- PDB - формат Protein Data Bank з повними метаданими, вторинною

структурою та підтримкою кількох моделей

- mmCIF - сучасний стандарт макромолекулярного CIF для складних білкових

структур

- MOL/MOL2 - MDL Molfile з явною зв'язністю зв'язків (V2000 і

V3000)

- SDF - Structure Data Files із підтримкою кількох молекул та

вилученням властивостей

- XYZ - простий формат координат для швидкої візуалізації

Доступ до онлайн-баз даних

Завантажуйте структури безпосередньо з трьох великих наукових баз даних,

не виходячи з Blender:

- RCSB PDB - понад 200 000 білкових структур за ідентифікатором PDB

- PubChem - мільйони малих молекул за назвою, CID або SMILES

- ChEMBL - база даних лікарських і біологічно активних сполук

Швидкі пресети для поширених молекул - аспірин, кофеїн, ібупрофен,

пеніцилін - дають змогу почати візуалізацію миттєво.

7 стилів візуалізації

- Кульки та стрижні - атоми у вигляді сфер, з'єднаних циліндричними зв'язками, найбільш

універсальний стиль загального призначення

- Заповнення простору (CPK) - сфери з повним радіусом Ван дер Ваальса, що показують справжній

молекулярний об'єм

- Каркас - лише тонкі лінії зв'язків, швидкий рендеринг великих молекул

- Палички - товсті зв'язки без сфер атомів, що підкреслюють зв'язність

- Cartoon - вторинна структура білка зі спіралями у вигляді спіралей,

листами у вигляді стрілок і петлями у вигляді трубок

- Стрічка - плавна траса остова крізь альфа-вуглеці для загального огляду

білка

- Поверхня - молекулярна поверхня на основі метаболів для представлення за Ван дер Ваальсом або

доступної для розчинника

8 кольорових схем

- CPK - стандартне розфарбовування елементів (вуглець сірий, кисень червоний, азот

синій)

- Ланцюг - окремі кольори для кожного білкового ланцюга в багатоланцюгових комплексах

- Залишок - розфарбовування за типом амінокислоти (гідрофобні, полярні, заряджені)

- Вторинна структура - спіралі червоні, листи жовті, петлі сірі

- B-фактор - градієнт температурного фактора для візуалізації гнучкості

- Гідрофобність - карта гідрофобності залишків для аналізу поверхні

- Веселка - градієнт від N-кінця до C-кінця

- Власна - розфарбовування кожного атома за вашим вибором

Визначення вторинної структури

Вбудований DSSP-подібний алгоритм автоматично визначає альфа-спіралі,

бета-листи та петльові ділянки за атомними координатами, без стороннього

програмного забезпечення. Використовується для стилів Cartoon і Стрічка, а також для розфарбовування за

вторинною структурою.

Анімація

Оживіть молекули за допомогою вбудованих інструментів анімації:

- Обертання - обертання навколо однієї осі з регульованою швидкістю та плавністю

- Перекидання - одночасне обертання навколо кількох осей для динамічної презентації

- Тремтіння - ефекти атомних коливань, що імітують тепловий рух

- Поворотний стіл - автоматична камера, що облітає молекулу по орбіті

Експорт, готовий до публікації

Експортуйте рендери високої якості, оптимізовані для наукових журналів:

- Пресети для журналів Nature, Science, Cell з правильним оформленням і

роздільною здатністю

- Пресети роздільної здатності від HD до 4K, квадратні формати та

розміри під конкретні журнали при 300 DPI

- Розміри постерів A0 і A1 з друкарською роздільною здатністю

- Формати виводу: PNG, JPEG, TIFF, EXR з глибиною кольору 8 або 16 біт

- Опція прозорого фону

- Підтримка рушіїв рендерингу Cycles і EEVEE

Пресети матеріалів

6 стилів матеріалів для різних потреб презентації: глянцевий, матовий,

металевий, скляний, стиль журналу Nature і стиль журналу Science. Кожен

керує шорсткістю, металевістю, дзеркальністю та пропусканням

для фізично точного рендерингу.

Продуктивність

Автоматична система LOD спрощує геометрію для молекул, що мають понад

10 000 атомів. Кешування матеріалів запобігає дублікатам. Налаштовувана якість атомів

і зв'язків дає змогу збалансувати візуальну точність і швидкодію

у в'юпорті.

Повна періодична таблиця

97 елементів від водню до урану з точною атомною масою,

ковалентним радіусом, радіусом Ван дер Ваальса та стандартними кольорами CPK. 20

стандартних амінокислот зі значеннями гідрофобності для аналізу

на рівні залишків.

Вимоги

- Blender 4.0 або новіший

- Без зовнішніх залежностей: використовуються лише вбудовані модулі Blender

- Підключення до інтернету потрібне лише для завантаження з онлайн-баз даних

- Працює в Windows, macOS і Linux